|
|
The delta subunit of RNA polymerase from gram positive bacteria
Matějčková, Jitka ; Krásný, Libor (advisor) ; Beranová, Jana (referee)
1 Abstrakt Aby bakteriální buňka přežila neustále se měnící podmínky, musí se na ně adaptovat. Tato adaptace je podmíněna změnou genové exprese. Klíčovým krokem genové exprese je transkripce. Hlavním enzymem bakteriální transkripce je RNA polymerasa (RNAP), což je esenciální vícepodjednotkový enzym. RNAP je nejvíce prostudována u Escherichia coli, modelového organismu gram negativních bakterií. Porovnala jsem E. coli a Bacillus subtilis (zástupce gram pozitivních bakterií) a shrnula jsem rozdíly v RNAP a transkripci. Jejich RNA polymerasy se liší přítomností podjednotky δ u gram pozitivních bakterií. Tato podjednotka zvyšuje promotorovou selektivitu, recykluje jádro RNAP a celkově stimuluje syntézu RNA. Podjednotka δ ovlivňuje sporulaci a virulenci některých bakterií. V této práci jsem shromáždila současné poznatky o jednotlivých částech genové exprese, zejména o regulaci iniciace transkripce a o podjednotce δ RNAP.
|
|
| |
|
|
Regulation of transcription in Gram-positive bacteria
Rabatinová, Alžběta ; Krásný, Libor (advisor) ; Bobek, Jan (referee) ; Valášek, Leoš (referee)
Bacteria are the most abundant organisms on the planet. They live almost in all environments, including those that are most extreme. All land and water ecosystems depend heavily upon their activity. Bacteria play essential roles in cycling of nutrients such as carbon, nitrogen, and sulphur. Due to their short cell cycle, they must be able to swiftly adapt to the conditions of their habitat to survive. Microbial growth itself is an autocatalytic process. There are three distinct phases of the growth curve: lag, exponential (log), and stationary. Bacterial cells must change their gene expression between these phases in order to adapt to the new conditions. The first stage of gene expression is transcription. The key enzyme of this stage is RNA polymerase (RNAP) that transcribes DNA into RNA. RNAP is regulated by a number of accessory proteins and also small molecule effectors. Understanding how RNAP functions is essential for understanding how bacteria cope with changing environments. This Thesis presents studies of selected aspects of bacterial gene expression regulation at the level of transcription, using Bacillus subtilis as the model organism. The first part of this Thesis focuses on protein determinants of the ability of RNAP to be regulated by the concentration of the initiating nucleoside...
|
|
| |
|
|
The delta subunit of RNA polymerase from gram positive bacteria
Matějčková, Jitka ; Beranová, Jana (referee) ; Krásný, Libor (advisor)
1 Abstrakt Aby bakteriální buňka přežila neustále se měnící podmínky, musí se na ně adaptovat. Tato adaptace je podmíněna změnou genové exprese. Klíčovým krokem genové exprese je transkripce. Hlavním enzymem bakteriální transkripce je RNA polymerasa (RNAP), což je esenciální vícepodjednotkový enzym. RNAP je nejvíce prostudována u Escherichia coli, modelového organismu gram negativních bakterií. Porovnala jsem E. coli a Bacillus subtilis (zástupce gram pozitivních bakterií) a shrnula jsem rozdíly v RNAP a transkripci. Jejich RNA polymerasy se liší přítomností podjednotky δ u gram pozitivních bakterií. Tato podjednotka zvyšuje promotorovou selektivitu, recykluje jádro RNAP a celkově stimuluje syntézu RNA. Podjednotka δ ovlivňuje sporulaci a virulenci některých bakterií. V této práci jsem shromáždila současné poznatky o jednotlivých částech genové exprese, zejména o regulaci iniciace transkripce a o podjednotce δ RNAP.
|
guest ::
